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中國科學家啟動"萬種原生生物基因組計劃"
2019-12-31
中國新聞網

  “萬種原生生物基因組計劃”30日在武漢啟動。該計劃由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起,旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規模的原生生物遺傳資源數據庫。

  原生生物主要是由單細胞真核生物組成的一大類群,包括單細胞真核藻類和原生動物等。其分布廣泛,存在于任何水環境,已描述的物種數逾6萬種,未知種類難以估量。

  據介紹,目前,國內外針對生物五大界中的四界(動物界、植物界、真菌界和原核生物界)均啟動了大型基因組測序計劃,原生生物界成為唯一沒有啟動大規?;蜃椴廡蚣蘋納錮噯?。

  中國原生生物學研究始于上世紀20年代。作為中國原生生物學(原生動物學和藻類學)的發源地,中科院水生所建有保藏了2500余種株真核藻類和近600種株原生動物的國家藻類和原生動物種質庫,近年來,依托原生生物基因組測序和生物信息分析平臺已完成500余種原生生物的基因組測序。

  本次“萬種原生生物基因組計劃”由中科院水生所牽頭啟動。該所副所長、研究員繆煒介紹,該計劃將依托各發起單位保藏的3000多種株真核藻類和原生動物的種質資源,通過持續的樣品采集和宏基因組數據挖掘,在未來3年(2020年—2022年)完成約一萬種原生生物的基因組測序和分析,將包括原生生物全部26個門/類,覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。

  據了解,該計劃將以開放聯盟模式運行,國內外有興趣研究團隊均可加入。繆煒表示,該計劃的開展將對理解生物多樣性形成機制、多細胞生物/有性生殖的起源與演化等重大基礎生命科學問題,推動與生態環境?;?、營養健康和疾病防治相關原生生物種質遺傳資源的挖掘與應用實踐具有重要意義。

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